No hay cura para la infección por el VHS, aunque existen medicamentos antivirales que tienen algún efecto en la disminución de los síntomas y de la extensión de los brotes de herpes. Algunos de estos medicamentos también pueden prevenir futuros brotes.

Para obtener los mejores resultados con el tratamiento con medicamentos se debe comenzar durante la fase de pródromos (avisos de que está a punto de empezar la infección) antes de que sean visibles las ampollas. Dependiendo de la duración del brote, el tratamiento farmacológico puede durar hasta 10 días.

El fármaco de elección para la infección por herpes es el Aciclovir, que puede administrarse por vía intravenosa o por vía oral. Se puede aplicar directamente a las ampollas en forma de crema, pero no es muy eficaz en esta forma. También lo hay líquido para niños. El aciclovir es eficaz en el tratamiento tanto de la infección primaria y los brotes recurrentes. Cuando se toma por vía oral para prevenir un brote y reduce la frecuencia.