El tratamiento de la fimosis puede ser conservador al principio y durante los primeros meses o años de vida, realizándose estiramientos suaves del prepucio durante un período de tiempo. El tratamiento, que siempre será prescrito por un médico, puede incluir la aplicación de pomadas tópicas especializadas. La opción definitiva para los casos resistentes al tratamiento conservador es el tratamiento quirúrgico, por ejemplo, la circuncisión, consistente en la extirpación del prepucio. Otro procedimiento quirúrgico separa el prepucio del glande preservando el prepucio, procedimiento menos traumático que la circuncisión.

En el caso de los niños, los pacientes y sus padres deben ser advertidos de evitar realizar una retracción forzada o prematura del prepucio y evitar el exceso de lavado con jabón. 

El tratamiento de la parafimosis se centra en la reducción de la inflamación del glande y el prepucio. Se trata de una urgencia médica y debe ser tratada de modo inmediato. 

La aplicación de medidas menos agresivas como la aplicación de frío local para reducir la inflamación puede dar buenos resultados, si ello no resuelve la situación será necesario acudir a medidas más agresivas. En los casos graves un cirujano puede hacer pequeños cortes en el prepucio para liberarlo. La circuncisión también puede ser utilizada como un tratamiento para la parafimosis, debiendo ser un médico siempre quien se encargue del tratamientio de este grave problema.