No existen procedimientos de vacunación o medicamentos para prevenir la amibiasis. Por otra parte, las personas que han tenido la enfermedad pueden volver a infectarse. La prevención requiere una higiene personal efectiva y general de la comunidad.

Entre las medidas preventivas destacamos las siguientes:

• Purificación de agua potable (por filtración, ebullición o tratamiento con yodo)
• Correcta manipulación de los alimentos.
• Cuidadosa eliminación de las heces humanas
• Control de los contactos de los pacientes con amebiasis