En la mayoría de los casos el tratamiento de los síntomas es lo único posible. Los medicamentos pueden reducir la duración y la severidad de una infección aguda, pero sólo tienen el 50% de efectividad, en el mejor de los casos, en eliminar los organismos.

Los efectos cardíacos se manejan con marcapasos y medicamentos. Las complicaciones del esófago requieren métodos endoscópicos o quirúrgicos para mejorar el vaciamiento esofágico, similares a los utilizados para tratar el trastorno conocido como acalasia. El estreñimiento se trata incrementando l ingestión de fibra y con laxantes o eliminando las partes enfermas del colon.