Las complicaciones de la esclerosis tuberosa varían, dependiendo de dónde se desarrollan los tumores.

• Los tumores en el cerebro puede bloquear el flujo del líquido cefalorraquídeo. Esto puede causar varios signos y síntomas como náuseas, dolores de cabeza y cambios de comportamiento
• Los tumores en el corazón pueden bloquear el flujo de sangre o causar problemas con el ritmo cardíaco (arritmias). Estos tumores suelen ser más grandes al nacer y disminuyen a medida que el niño crece
• Los tumores en el ojo pueden interferir con la visión si bloquean demasiado el tejido sensible a la luz en la parte posterior del ojo (retina)
• Los tumores en el riñón puede conducir a insuficiencia renal. En raras ocasiones, los tumores en el riñón se pueden convertir en cancerosos
• Los tumores en los pulmones puede conducir a una insuficiencia pulmonar