El tratamiento del hipotiroidismo depende de su causa y del tipo de hipotiroidismo de que se trate. En los casos en los que se precise medicación, normalmente el tratamiento se realizará con hormona tiroidea sustitutiva de la hormona que el organismo no es capaz de producir o produce en menor cantidad. En cualquier caso, el tratamiento deberá ser prescrito y ser controlado por un médico.