La enfermedad de Behçet normalmente va y viene en ciclos impredecibles. Los síntomas de la enfermedad pueden ser menos severos después de unos 20 años.

Aunque el tratamiento no puede curar la enfermedad de Behçet, se pueden controlar los signos y síntomas y reducir el riesgo de complicaciones. Por ejemplo, la uveítis no tratada puede conducir a una disminución de la visión o incluso ceguera. Las personas con signos y síntomas oculares de la enfermedad de Behçet deben ser cuidadosamente supervisadas por un oftalmólogo ya que el tratamiento puede ayudar a prevenir esta complicación. Otras complicaciones de la enfermedad de Behçet dependen del conjunto específico de signos y síntomas que se experimenten.