El uso de medicamentos contra la esquistosomiasis, como prazicuantel, oxamniquina y metrifonato, han demostrado ser seguro y eficaz. El prazicuantel es eficaz contra todas las formas de schistososmiasis y tiene pocos efectos secundarios. Este medicamento se administra en dosis de 2-3 a lo largo de un solo día. La oxamniquina se suele utilizar en África y América del Sur para el tratamiento de la esquistosomiasis intestinal. El metrifonato se ha encontrado  ser seguro y eficaz en el tratamiento de la esquistosomiasis urinaria. Los pacientes suelen ser examinados por la presencia de huevos vivos a los tres y seis meses después del tratamiento. Si el número de huevos excretados no ha disminuido significativamente, el paciente puede requerir otro curso de medicación.