Si se trata a tiempo, el pronóstico es muy bueno y se espera una recuperación completa. La enfermedad es tratable, pero la gente puede morir a causa de los efectos de la esquistosomiasis no tratada. La gravedad de la enfermedad depende del número de gusanos o la carga parasitaria, además de cuánto tiempo la persona ha estado infectada. Con tratamiento, el número de gusanos se pueden reducir sustancialmente y las condiciones secundarias pueden ser tratadas. El objetivo de la Organización Mundial de la Salud es reducir la gravedad de la enfermedad en lugar de detener completamente la transmisión de la enfermedad. Hay, sin embargo, poca inmunidad natural a la reinfección. Las personas tratadas por lo general no requieren retratamiento por 2-5 años en zonas de baja transmisión. La Organización Mundial de la Salud ha realizado una investigación para desarrollar una vacuna contra la enfermedad y es  una de sus prioridades.