La historia clínica y la exploración física son fundamentales a la hora de establecer el diagnóstico. Entre otras pruebas diagnósticas que son útiles, cuando no hay antecedentes familiares de alergia y el niño no tiene asma ni alergia nasal, se incluye un examen de sangre para cuantificar el anticuerpo de la alergia (IgE), que se encuentra elevado en el 80% de pacientes con dermatitis atópica, así como pruebas cutáneas de alergia.

Estas últimas son útiles para identificar alimentos o sustancias inhaladas tales como ácaros del polvo, caspas animales o pólenes, frente a los cuales el paciente está sensibilizado, es decir, es alérgico, y que pueden ser los responsables de las exacerbaciones de las lesiones cutáneas.