Si los cambios de estilo de vida, sobre todo evitar ofender a los alimentos, no ayudar a la dispepsia, también son de venta libre y medicamentos que pueden ayudar. 

La mayoría están diseñados para reducir el ácido del estómago o los alimentos se mueven desde el estómago hasta el intestino delgado. Los tipos de medicamentos para minimizar los signos de la dispepsia son:

• Los antiácidos: Alka-Seltzer, Maalox, Mylanta, Rolaids, Riopan y otros están disponibles sin receta médica y el trabajo al neutralizar el ácido del estómago. Los efectos secundarios incluyen diarrea y estreñimiento. Estos son a menudo los primeros medicamentos los médicos recomiendan
• H-2-antagonistas de los receptores: Estos incluyen Axid, Tagamet, Pepcid y Zantac, que están disponibles sin receta o con receta médica. Ellos reducen el ácido estomacal y trabajan más, pero no tan rápido, como los antiácidos. Los efectos secundarios pueden incluir dolor de cabeza, náuseas, vómitos, estreñimiento, diarrea y sangrado o moretones
• Los inhibidores de la bomba de protones: Aciphex, Nexium, Prevacid, Prilosec, Protonix y Zegerid son más eficaces para las personas que también tienen la enfermedad por reflujo gastroesofágico (ERGE). Estos medicamentos reducen el ácido del estómago y son más fuertes que los ARH2. Están disponibles por la prescripción, Prilosec, aunque también viene en la resistencia contra más. Los posibles efectos secundarios incluyen dolor de espalda, dolor, tos, dolor de cabeza, mareos, dolor abdominal, gases, náuseas, vómitos, estreñimiento y diarrea. El uso a largo plazo tiene, rara vez, se ha asociado con fracturas óseas
• Procinéticos: Los medicamentos como Reglan puede ser útil si su estómago se vacía lentamente. Las personas que toman este medicamento recetado con frecuencia los efectos secundarios, como fatiga, somnolencia, depresión, ansiedad y espasmos musculares involuntarios
• Antibióticos: Si la bacteria que causa la enfermedad de úlcera péptica (Helicobacter pylori) es la causa de su indigestión, el médico puede prescribir un antibiótico. Los efectos secundarios incluyen malestar estomacal, infecciones por hongos y diarrea
• Los antidepresivos: Si una evaluación minuciosa no revela la causa de sus síntomas y los tratamientos convencionales anteriores no funcionan, el médico puede recomendar un medicamento antidepresivo

Estos medicamentos pueden mejorar las molestias de la indigestión al disminuir la sensación de dolor. Los efectos secundarios pueden incluir dolores de cabeza, náuseas, sudoración nocturna, la agitación y el estreñimiento.