Cuando la exostosis sigue siendo pequeña, sobre todo, no habrá ningún tipo de complicación. 

Pero a medida que crece, va aumentando la presión a los nervios adyacentes, los tendones  o en los músculos o los huesos provocando un progresivo deterioro de las complicaciones.

Las complicaciones suelen variar de acuerdo al sitio, las estructuras implicadas y la intensidad de la presión. En muchas ocasiones los pacientes creen que la patología puede tratarse de cáncer por las deformaciones del hueso.  

Si se comprimen

• El nervio que a menudo causa la neuralgia, provoca una respuesta inmune en forma de disparo nervioso
• Los vasos sanguíneos, provoca una disminución de aporte sanguíneo a los órganos distales, que puede causar calambres y adormecimiento
• Los músculos, pueden causar calambres, fascitis (inflamación), etc.
• El dolor en los huesos, se produce una restricción del movimiento y, a veces incluso puede dar lugar a fracturas

Aparte de estas complicaciones, la exostosis puede causar desfiguración y discapacidad en los casos graves.