En la mayoría de los casos que se han estudiado de mutismo selectivo se ha encontrado que los niños con mutismo selectivo tienen una predisposición hereditaria a la ansiedad.

A menudo son personas que han inhibido temperamentos de manera que sobre estimula una parte del cerebro denominada amígdala. Esta zona recibe las indicaciones de las posibles amenazas y pone en marcha un sistema de aislamiento.

Algunos casos de mutismo selectivo están centrados en el fallo del sistema de aislamiento para proteger la amígdala de una excitabilidad excesiva. Esto causa la ansiedad, que puede causar al niño a “cerrarse” y no ser capaz de hablar. 

Muchos niños con mutismo selectivo pueden tener algunas dificultades en el procesamiento auditivo. Alrededor del 20-30% de los niños con la enfermedad tienen trastornos del habla o el lenguaje que añaden tensión a situaciones en las que se espera que el niño hable.

No existe una pauta general por la cual los niños o las personas que padecen mutismo selectivo puedan haber sufrido abusos, negligencia o traumas, aunque en algunos de los casos estudiados se daban esas características.