Las fístulas se pueden dar en muchas partes del cuerpo. Las principales causas de las fístulas son variadas, algunas de las más relevantes son:

• Fistulas que se producen entre una arteria y una vena, reciben el nombre de arteriovenosas. Existe la Arteriovenosa pulmonar que se produce en un pulmón, la arteria y la vena pulmonar se conectan, permitiendo que la sangre esquive el proceso de oxigenación en el pulmón
• Fístulas que se crean durante una operación quirúrgica de vesícula, conectando las vías biliares con la superficie de la piel, son las llamadas fístulas biliares
• Fistulas en la zona vaginal, generando un orificio anormal en el cuello uterino o a lo largo de las trompas o el resto de la anatomía de la estructura recibe el nombre de fístula cervical
• Las fístulas que se producen en el espacio intracraneal o en la zona del seno paranasal reciben el nombre de craneosinusales
• Las que unen los intestinos con las zonas genitales tanto de hombres como de mujeres reciben el nombre de  Enterovaginales
• Las fistulas que se producen en la zona fecal o anal, provocan que las heces se evacuen por un lugar diferente al año
• Una de la más problemáticas es la fístula gástrica que se produce desde el estómago hacia la superficie cutánea, provocando quemazón de los tejidos  y deterioro por los ácidos del estómago