Aunque la mayoría de las personas con prolapso de la válvula mitral no tienen problemas, pueden surgir complicaciones. Las complicaciones tienden a ocurrir en adultos de mediana edad o mayores. Entre los principales signos y síntomas podemos encontrar:

• Regurgitación de la válvula mitral: La complicación más frecuente es la regurgitación de la válvula mitral (insuficiencia mitral), una condición en la cual la sangre se filtra la válvula hacia la aurícula izquierda. Tener presión arterial alta o tener sobrepeso aumenta el riesgo de regurgitación de la válvula mitral. Si la insuficiencia es grave, el paciente podría necesitar cirugía para reparar o reemplazar la válvula hasta el fin de evitar la aparición de complicaciones, como insuficiencia cardíaca
• Arritmias: Ritmos irregulares del corazón pueden producirse en personas con prolapso de la válvula mitral. Estos ocurren con más frecuencia en las cámaras superiores del corazón, y si bien pueden ser molestos, no suelen ser mortales. Las personas con insuficiencia mitral severa, o una deformidad severa de la válvula mitral, son los más susceptibles a los problemas graves del ritmo
• La infección de la válvula del corazón: El interior del corazón tiene cuatro cámaras y cuatro válvulas recubiertas por una membrana delgada que se llama endocardio

La endocarditis es una infección de este revestimiento interior. Una válvula mitral anormal aumenta la probabilidad de contraer la endocarditis de las bacterias, que pueden dañar aún más la válvula mitral.

Los médicos solían recomendar que algunas personas con prolapso de la válvula mitral tomar antibióticos antes de ciertos procedimientos dentales o médicos para prevenir la endocarditis, pero ya no.