El tratamiento específico para la atrofia muscular espinal será determinado por el médico basándose en lo siguiente:

• La edad del paciente, su estado general de salud y sus antecedentes médicos
• La gravedad del trastorno
• El tipo de atrofia muscular espinal
• La tolerancia a determinados medicamentos, procedimientos o terapias
• Las expectativas para la evolución del trastorno

El objetivo del tratamiento es prevenir problemas respiratorios y proporcionar atención nutricional adecuada al niño dado que esta enfermedad puede afectar a los músculos respiratorios y de la deglución.