El proceso de diagnóstico de la enfermedad de Whipple suele incluir las siguientes pruebas:

• Examen físico: El médico probablemente comenzará con un examen físico completo, en busca de signos y síntomas que sugieren la presencia de esta enfermedad, por ejemplo, dolor abdominal y oscurecimiento de la piel, sobre todo en las partes expuestas del sol del cuerpo
• Biopsia: Un paso importante en el diagnóstico de la enfermedad de Whipple es tomar una muestra de tejido (biopsia), más a menudo se obtienen de la mucosa del intestino delgado. Para ello, el médico general realiza una endoscopia superior. El procedimiento utiliza un, ámbito de aplicación flexible delgado que pasa a través de la boca, esófago, garganta y estómago hasta el intestino delgado. El ámbito de aplicación permite al médico para ver las vías digestivas y obtener biopsias. Durante el procedimiento, toman muestras de tejido de varios sitios dentro del intestino. Este tejido se examinaron microscópicamente para detectar la presencia de bacterias que causan enfermedades y las lesiones, y específicamente para Tropheryma bacterias Whipple. Si las biopsias del intestino delgado no confirman el diagnóstico, el médico podría biopsia de un ganglio linfático agrandado o realizar otras pruebas si se presentan síntomas neurológicos, como convulsiones. Una prueba basada en ADN conocida como reacción en cadena de polimerasa (PCR), que está disponible en algunos centros médicos, puede detectar Tropheryma Whipple bacterias en muestras de biopsias o muestras de fluido espinal
• Los análisis de sangre: El médico también puede ordenar exámenes de sangre, como un conteo sanguíneo completo (CBC). Los exámenes de sangre pueden detectar ciertas afecciones asociadas con la enfermedad de Whipple, en particular la anemia, que es una disminución en el número de glóbulos rojos, y las concentraciones bajas de albúmina, una proteína en la sangre