También llamada IPLV. Es una de las principales causas por la que puede aparecer diarrea, dicha intolerancia puede aparecer nada más nacer o tras algún episodio diarreico debido a otra causa. Habitualmente está relacionado con una inmadurez del aparato digestivo.

Los principales cuidados preventivos son: prolongar la lactancia materna (la madre debe seguir una dieta sin leche de vaca, huevos y soja, etc.) o en su defecto proporcionar al niño una fórmula especial; retrasar la introducción de la alimentación complementaria hasta el sexto mes; a partir de los doce meses ir introduciendo en la dieta y en cantidades crecientes pescado y yema y clara de huevo.