El tratamiento se centra en la corrección de la condición subyacente que causa la acidosis:

• En los pacientes con enfermedades pulmonares crónicas esto puede incluir el uso de un broncodilatador o medicamentos esteroides
• En algunas condiciones se puede utilizar suplemento de oxígeno suministrado a través de una máscara o pequeños tubos insertados en los orificios nasales, sin embargo, un exceso de oxígeno en pacientes con enfermedad pulmonar puede hacer que la acidosis empeore
• Se pueden utilizar antibióticos para tratar infecciones
• Si la acidosis está relacionada con una sobredosis de narcóticos o se sospecha de una sobredosis de drogas, el paciente puede recibir una dosis de naloxona, un fármaco que bloquea los efectos respiratorio-depresivos de los estupefacientes
• Puede ser necesario el uso de ventilación mecánica, como un respirador
• Si la acidosis respiratoria ha provocado que el cuerpo compense mediante el desarrollo de alcalosis metabólica, los síntomas de esta condición también necesitan ser tratados