El tratamiento oportuno con antibióticos en combinación con el drenaje de líquido de la articulación por lo general se resuelve la infección. Si se retrasa el tratamiento, sin embargo, la infección puede llevar rápidamente a la degeneración articular y el daño permanente.

Entre las principales complicaciones que puede sufrir el paciente como consecuencia de la artritis séptica podemos encontrar:

• Osteoartritis
• Conjunto deformidad

En casos severos, la articulación puede necesitar ser reconstruido quirúrgicamente. Si la infección afecta a una prótesis de la articulación, la prótesis puede necesitar ser reemplazada.