El tratamiento para balanitis depende de la causa específica, que puede variar de un caso a otro. Los antibióticos se utilizan para tratar infecciones bacterianas, mientras que los antifúngicos tópicos, como el clotrimazol, puede combatir la balanitis por cándida. Si es una reacción alérgica la que está produciendo los síntomas, el objetivo es identificar el agente químico responsable. Pueden utilizarse pomadas o cremas para aliviar la irritación de piel.

Independientemente de cuál sea la causa, lo importante es mantener bien limpio el pene diariamente para aliviar los síntomas. Si la condición persiste o si la inflamación interfiere con la micción, puede ser aconsejable la realización de una circuncisión.