Con el fin de diagnosticar el cáncer del pene, el médico examina el pene del paciente en busca de bultos u otras anomalías. Se puede solicitar una muestra de tejido o una biopsia para distinguir las células cancerosas de la sífilis y de verrugas del pene. Si los resultados confirman un diagnóstico de cáncer, se realizan pruebas complementarias para determinar si la enfermedad se ha diseminado a otras partes del cuerpo.