No se sabe específicamente cuál es la causa ciclotimia. Como ocurre con muchos trastornos mentales, las investigaciones demuestran que pueden resultar de una combinación de:

• La herencia: La ciclotimia tiende a darse en familias
• Los procesos bioquímicos del organismo, como cambios en la química del cerebro
• El medio en el que se mueve el paciente