Se cree que la ciclotimia es un trastorno relativamente raro, pero las estimaciones reales son difíciles de precisar porque las personas pueden ser diagnosticadas con otros trastornos del estado de ánimo, como depresión.

La ciclotimia suele comenzar durante la adolescencia o la juventud. La condición afecta a aproximadamente por igual a hombres y mujeres.