Los medicamentos pueden ayudar a controlar los síntomas de la ciclotimia y prevenir los episodios de hipomanía y depresión. Los medicamentos que generalmente se utilizan para tratar la ciclotimia son:

• Estabilizadores del estado de ánimo: Son los medicamentos más comúnmente recetados para el trastorno ciclotímico. Estos medicamentos ayudan a regular y estabilizar el estado de ánimo para que no fluctúen entre la depresión y la hipomanía. El litio se utiliza ha sido como un estabilizador del humor y es generalmente la primera línea de tratamiento para los episodios hipomaníacos. El médico le puede recomendar que tome estabilizadores del estado de ánimo para el resto de su vida para prevenir y tratar los episodios hipomaníacos
• Anticonvulsivos: Se utilizan para evitar los cambios de humor, como el ácido valproico , divalproex sódico y la lamotrigina 
• Otros medicamentos: Ciertos medicamentos antipsicóticos atípicos, como olanzapina y risperidona, pueden ayudar a los pacientes que no se benefician de los medicamentos anticonvulsivos. Los medicamentos contra la ansiedad, como las benzodiazepinas, pueden ayudar a mejorar el sueño. Además, la quetiapina ha sido aprobada para tratar los episodios maníaco-depresivos del trastorno bipolar y también puede ser útil para el trastorno ciclotímico
• Antidepresivos: El uso de antidepresivos en el trastorno ciclotímico no suele ser recomendable, a menos que estén combinados con un estabilizador del estado de ánimo. Al igual que el trastorno bipolar, tomar sólo antidepresivos puede provocar episodios de manía potencialmente peligrosos. Antes de tomar antidepresivos, sopesar cuidadosamente los pros y los contras con el médico

Si un medicamento no funciona bien para el paciente, se pueden considerar otros. El médico puede aconsejar la combinación de ciertos medicamentos para obtener el efecto adecuado. Suelen pasar varias semanas antes de notar que la medicación produce una mejoría en los síntomas de la ciclotimia.

Hay que tener en cuenta que todos los medicamentos tienen efectos secundarios y posibles riesgos de salud. Ciertos medicamentos antipsicóticos pueden aumentar el riesgo de diabetes,  obesidad y presión arterial alta. Además, los medicamentos estabilizadores del ánimo pueden dañar al feto o al lactante. Las mujeres con trastornos ciclotímicos que quieren quedar embarazadas o que quedan embarazadas, deben explorar plenamente junto con el médico, los beneficios y los riesgos de los medicamentos.

–        Tratamiento en casa

La ciclotimia, en general, no es una enfermedad que pueda tratar el paciente por su cuenta, pero sí puede hacer algunas cosas por sí mismo basándose en su plan de tratamiento específico. Además del tratamiento profesional, el paciente puede seguir los siguientes pasos en cuanto al estilo de vida y el autocuidado de la ciclotimia:

• Tomar la medicación según las indicaciones: Resistir la tentación de saltarse la medicación. Si lo hace, los signos y síntomas ciclotimia es probable que vuelvan
• Prestar atención a las señales de advertencia: El paciente y el médico pueden identificar un patrón de episodios y lo que los provoca. Llame al médico si siente que está frente a un episodio. Involucre a los miembros de la familia o amigos en la observación de signos de advertencia. Abordar los síntomas a una edad temprana puede prevenir episodios
• Evitar las drogas y el alcohol: El alcohol y las drogas ilegales pueden desencadenar cambios de humor
• Consulte con el médico antes de tomar medicamentos prescritos por otro médico. A veces, otros medicamentos desencadenan episodios de trastorno bipolar o pueden interferir con los medicamentos que está tomando
• Mantener un registro: El seguimiento del estado de ánimo, las rutinas diarias y los eventos importantes en su vida pueden ayudar al paciente y al médico a entender el efecto de los tratamientos e identificar patrones de pensamiento y comportamientos asociados con síntomas ciclotímicos