La situación puede ser tan aguda que sea necesaria una cirugía en casos de urgencia. Esto es a menudo el caso cuando hay obstrucción intestinal. Con sangrado abundante o dolor severo, sea cual sea la causa, se requiere cirugía. Los puntos más acertados del diagnóstico se pueden lograr cuando el abdomen está abierto para su inspección durante un procedimiento quirúrgico. Esta situación se denomina abdomen agudo.

Si hay más tiempo (si no es una situación de emergencia), la mejor manera de diagnosticar el divertículo de Meckel es con un escáner nuclear. Se inyecta un isótopo radiactivo en el flujo sanguíneo que se acumulará en los sitios de sangrado o en el tejido del estómago. Si un pedazo de tejido del estómago o un charco de sangre aparece en la parte inferior del intestino, indica un divertículo de Meckel.