Los síntomas de la encefalitis varían desde muy leves hasta muy graves como por ejemplo:

• Dolor de cabeza
• Fiebre
• Letargo (somnolencia, disminución del estado de alerta y fatiga)
• Malestar
• Náuseas y vómitos
• Alteraciones visuales
• Temblores
• Disminución de la conciencia (somnolencia, confusión, delirio y pérdida del conocimiento)
• Rigidez del cuello
• Convulsiones

Los síntomas pueden progresar rápidamente, pasando de leves a graves en varios días o incluso horas.