La elección del tratamiento para la encefalitis depende de la causa. La encefalitis bacteriana se trata con antibióticos, la viral con medicamentos antivirales como aciclovir, ganciclovir, foscarnet, ribovarin y AZT. Los virus que responden a aciclovir incluyen el herpes simple.

Los síntomas de la encefalitis se pueden tratar con varios medicamentos: los corticosteroides, como prednisona y dexametasona se prescriben para reducir la inflamación y el edema cerebral; los medicamentos anti-convulsivos como Dilantin y fenitoína para controlar las convulsiones; La fiebre puede reducirse con paracetamol.

El paciente con encefalitis debe ser evaluado cuidadosamente ya que los síntomas cambian rápidamente. Pueden requerirse análisis de sangre regulares para medir los niveles de fluidos y sales en sangre.