El paciente será hospitalizado para que pueda recibir antibióticos por vía intravenosa. Se necesita un tratamiento a largo plazo de altas dosis de antibióticos para deshacerse de la bacteria. El tratamiento suele administrarse durante 4-6 semanas, dependiendo del tipo específico de bacteria. Los análisis de sangre ayudarán al médico a elegir el mejor antibiótico.

La cirugía puede ser necesaria para reemplazar las válvulas cardíacas dañadas.