No hay pruebas específicas para diagnosticar la enfermedad de Kawasaki. El diagnóstico suele ser un proceso de descarte de enfermedades que causan signos y síntomas similares, como:

• Fiebre escarlata, causada por bacterias denominadas estreptococos que produce fiebre, sarpullido, escalofríos y dolor de garganta
• Artritis reumatoide juvenil
• Síndrome de Stevens-Johnson, un trastorno de las membranas mucosas
• Síndrome de shock tóxico
• Sarampión
• Algunas enfermedades transmitidas por garrapatas

El médico puede realizar un examen físico y otras pruebas para ayudar en el diagnóstico, como por ejemplo:

• Análisis de orina: Estas pruebas ayudan a descartar otras enfermedades
• Análisis de sangre: Además de ayudar a descartar otras enfermedades, en un análisis de sangre se comprueba el recuento de glóbulos blancos, que es probable que sea elevado y la presencia de anemia e inflamación, indicadores de la enfermedad de Kawasaki
• Electrocardiograma: Esta prueba utiliza electrodos que se adhieren a la piel para medir los impulsos eléctricos del corazón. La enfermedad de Kawasaki puede causar complicaciones graves de corazón
• Ecocardiograma: Esta prueba utiliza imágenes de ultrasonido para mostrar cómo está funcionando el corazón y proporciona evidencia indirecta del funcionamiento de las arterias coronarias