Para alcanzar el  diagnóstico, el  médico especialista se  basa en  los  datos proporcionados por una serie de procedimientos con los que trata de conseguir información acerca del estado del tubo digestivo:

• Presencia de sangre oculta en heces
• Imagen radiológica del intestino delgado relleno con contraste de bario
• Enema de bario para la imagen del colon
• Fibrocolonoscopia
• Toma de muestras de tejido de la pared mucosa para examen microscópico

–      Diferencias entre la enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa

A   pesar de  estas  similitudes sintomáticas existen claras  diferencias entre enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa:

• En la enfermedad de Crohn, aunque las lesiones predominan en la porción más distal del intestinal delgado (el íleon) e incluso en la más proximal del colon, no obstante pueden aparecer en cualquier lugar del tubo digestivo, desde la boca al ano. Las zonas de la pared intestinal afectadas por la inflamación, en las que se desarrollan úlceras, se extienden discontinuamente por la mucosa digestiva, a modo de manchas separadas por áreas sanas
• En la colitis ulcerosa, por el contrario, la   inflamación,  en   la   que    pueden desarrollarse  úlceras    pequeñas  que sangran, sólo afecta al colon y al recto, se limita a la mucosa  y  se extiende de modo  continuo,  y   no   en  forma  deislotes