Cuando se padece una enfermedad como el espermatocele es poco probable que cause complicaciones. Sin embargo, si el espermatocele es doloroso o ha crecido tanto que es lo que causa molestias, puede que tenga que someterse a una operación para quitar el espermatocele.

La extirpación quirúrgica puede dañar el epidídimo o el conducto deferente, un tubo que transporta los espermatozoides desde el epidídimo. El daño a cualquiera puede reducir la fertilidad. Otra posible complicación que puede ocurrir después de la cirugía es que el espermatocele puede volver.