Los tratamientos de la FC se dirigen a los síntomas y a las complicaciones. Los objetivos son prevenir las infecciones, reducir el espesor de las secreciones en los pulmones, mejorar el flujo aéreo y mantener una nutrición adecuada.

Para cumplir estos objetivos se dispone de:

• Antibióticos: uno de los mayores inconvenientes de su uso a largo plazo es el desarrollo de resistencias bacterianas
• Fármacos que tratan de disminuir el espesor de las secreciones: la alfa dornasa es  una enzima que, administrada  bajo   la   forma   de aerosol, hace menos espeso al moco y más fácil de expulsar con la tos
• Bronco dilatadores: estos fármacos, como el albuterol (Ventolín®) pueden mantener abiertos los bronquios y facilitar su limpieza con la tos
• Drenaje bronquial: mediante fisioterapia del tórax (“clapping”)
• Fermentos y dietas apropiadas: administración de enzimas pancreáticas por vía oral, vitaminas y dieta rica en calorías