La infección por Giardia casi nunca es mortal en los países industrializados, pero puede causar síntomas persistentes y graves complicaciones, especialmente en lactantes y niños menores de 5 años. Las complicaciones más comunes incluyen:

• Deshidratación: A menudo una consecuencia de la diarrea severa, deshidratación se produce cuando el cuerpo no tiene suficiente agua para llevar a cabo sus funciones normales
• Retraso en el desarrollo: Diarrea crónica de la infección por Giardia puede conducir y peligro físico y mental de los niños el desarrollo de la desnutrición
• Intolerancia a la lactosa: Muchas personas con infección por Giardia desarrollan intolerancia a la lactosa, la incapacidad de digerir adecuadamente azúcar de la leche. El problema puede persistir mucho tiempo después de la infección ha desaparecido