Una prueba simple de la piel similar a la propuesta para la tuberculosis dirá si una persona ha sido previamente infectada por el hongo H. capsulatum. La radiografía de tórax suele mostrar el daño pulmonar causado por el hongo, pero no conduce a un diagnóstico definitivo ya que el daño causado por otras enfermedades tiene una apariencia similar. El diagnóstico de la histoplasmosis diseminada crónica se puede hacer mediante el cultivo de una muestra de esputo u otros fluidos corporales en laboratorio para aislar el hongo. Se puede detectar la presencia de un antígeno producido en respuesta a la infección en la orina, el suero sanguíneo y el lavado de los pulmones o el líquido cefalorraquídeo. La mayoría de los casos de histoplasmosis primaria no son diagnosticados.