Hay muchas causas del labio leporino. Problemas genéticos que se transmiten de uno o ambos padres, drogas, virus u otras toxinas pueden causar defectos de nacimiento. El labio leporino puede ocurrir junto con otros síndromes o defectos de nacimiento.

Un labio hendido puede afectar la apariencia de la cara y puede producir problemas de alimentación y el habla, así como infecciones del oído. Los problemas pueden ir desde una pequeña muesca en el labio hasta un surco completo que va hasta el techo de la boca y la nariz. Estas características pueden ocurrir por separado o en conjunto.

Los factores de riesgo incluyen antecedentes familiares de labio leporino y otros defectos de nacimiento.