El linfogranuloma venéreo se trata con antibióticos por vía oral, generalmente tetraciclina o doxiciclina, durante 10-20 días o eritromicina o trimetoprima sulfametoxazol durante 14 días. Las mujeres embarazadas suelen ser tratadas con eritromicina en vez de las tetraciclinas, porque esta clase de medicamentos pueden dañar al feto.

En pacientes que han desarrollado complicaciones de segunda y tercera etapa puede ser necesario el tratamiento quirúrgico. El médico puede tratar las bubas, retirando el a través de una aguja hueca dentro de una jeringa de succión. Este procedimiento se llama aspiración. Fístulas y abscesos también pueden ser tratados quirúrgicamente. Los pacientes que sufren elefantiasis suelen ser tratados por cirujanos plásticos. Los pacientes con estenosis rectal pueden necesitar cirugía para evitar la obstrucción del intestino y la ruptura en el abdomen.