La eficacia de diversos fármacos, como las sulfonilureas, biguanidas y tiazolidinedionas, no ha sido investigada de forma sistemática, a pesar de que se han utilizado para controlar los niveles de glucosa en sangre en pacientes con lipodistrofias. La insulina se prescribe comúnmente para controlar la hiperglucemia. Por lo general se requieren muy altas dosis de insulina para controlar los niveles de glucosa en la sangre.

El tratamiento se basa en mejorar el control de la glucosa y prevenir las complicaciones, especialmente las enfermedades cardiovasculares. La dieta es un pilar del tratamiento junto con el ejercicio y la pérdida de peso. Una dieta baja en calorías reduce la resistencia a la insulina en días, incluso antes de que tenga lugar una pérdida de peso considerable.

Se han utilizado medicamentos como la metformina, troglitazona, y acarbosa, solos o en combinación, para mejorar la sensibilidad a la insulina, principalmente mediante la reducción de la glucosa en plasma por diferentes mecanismos. Todos estos tratamientos se pueden emplear para prevenir el desarrollo de diabetes tipo 2.

–        Terapia para niveles altos de colesterol y triglicéridos

Los pacientes con niveles extremadamente altos de triglicéridos en sangre deben ser tratados con fibratos (gemfibrozilo, clofibrato, benzafibrate, fenofibrato) y ácidos grasos poliinsaturados omega-3 los del aceites de pescado. Ocasionalmente, los pacientes pueden requerir una combinación de medicamentos, incluyendo los fibratos y estatinas (lovastatina, simvastatina, atorvastatina), sin embargo, el riesgo de toxicidad muscular puede limitar su uso. Se debe evitar la niacina ya que puede agravar la hiperglucemia. Las mujeres también deben evitar los anticonceptivos orales y la terapia de reemplazo hormonal posmenopáusica ya que los estrógenos en estas preparaciones pueden aumentar los niveles sanguíneos de triglicéridos.

–        Gestión de la lipodistrofia

Una causa importante de preocupación para los pacientes es la desfiguración estética debido a la pérdida de grasa, junto con una apariencia muscular excesiva, el hirsutismo, la pigmentación de color oscuro y el engrosamiento de la piel en el cuello, las axilas, la ingle y el tronco debido a la acantosis nigricans. La diabetes suele ser grave y puede producir complicaciones a corto y largo plazo, como una enfermedad renal, de la retina, cardíaca y una neuropatía. La hipertrigliceridemia (niveles elevados de grasas en la sangre) puede causar pancreatitis aguda y, posiblemente contribuye aún más a una pronta aparición de la enfermedad coronaria.

–        Gestión estética

Se utilizan varios métodos quirúrgicos, incluyendo la reconstrucción facial con colgajos de tejido trasplantado, la transposición de músculos faciales, implantes faciales e inyecciones de colágeno en las mejillas, aunque los resultados son variables. La liposucción y la lipectomía para la eliminación de exceso de grasa facial o del cuello se han realizado en varios pacientes con lipodistrofias parciales familiares.