No se dispone de un tratamiento curativo del lupus, aunque un tratamiento apropiado puede hacer más lento el proceso evolutivo de la enfermedad y controlar los síntomas asociados. El lupus es tratado con medicamentos que actúan sobre el sistema inmunitario y los fármacos elegidos por el médico dependen de la intensidad de la enfermedad y de los órganos afectados.

Tres tipos de fármacos son utilizados habitualmente, de acuerdo con la intensidad de la enfermedad: 

• Fármacos antiinflamatorios no-esteroideos, como la aspirina y el ibuprofeno
• Fármacos contra la malaria como la hidroxicloroquina
• Corticoesteroides: Aunque controlan la inflamación del lupus, producen efectos colaterales no deseables (hipertensión arterial, diabetes, aumento de peso, osteoporosis)

En las formas muy agresivas de la enfermedad se utilizan fármacos que inhiben la respuesta del sistema inmunitario (inmunosupresores) como la ciclofosmamida y la azatioprina.

En cualquier caso el tratamiento deberá ser prescrito y controlado por un médico.