La mastocitoma ocurre generalmente en la infancia y desaparece por sí sola. La urticaria pigmentosa (presente sola, sin enfermedad sistémica) también alivia o mejora drásticamente a medida que se acerca la adolescencia.

Para aliviar los síntomas de la mastocitosis sistémica se pueden utilizar varios medicamentos,  como los antihistamínicos y los medicamentos que reducen el ácido del estómago. Los dolores de cabeza responden al tratamiento de la migraña. Un medicamento llamado cromolina ayuda con los síntomas intestinales.