Los objetivos del tratamiento de la miocardiopatía hipertrófica son aliviar los síntomas y prevenir la muerte súbita cardiaca en personas de alto riesgo.

Las opciones de tratamiento para la cardiomiopatía hipertrófica incluyen medicamentos, cirugía u otros métodos para destruir el tejido obstructivo del corazón o la implantación de dispositivos para ayudar a controlar el ritmo del corazón.

• Tratamiento farmacológico: Varios medicamentos pueden ayudar a relajar el músculo y reducir la velocidad para que el corazón puede bombear más eficazmente. Algunos de los fármacos que el médico puede sugerir son bloqueadores beta, bloqueadores de los canales de calcio o medicamentos antiarrítmicos como la disopiramida o la amiodarona
• Miectomía septal: Esta es una operación a corazón abierto en la que el cirujano extrae una parte de la pared engrosada y agrandada del músculo del corazón (tabique) que separa las dos cámaras inferiores del corazón (ventrículos). La extracción de parte de este músculo agrandado mejora el flujo sanguíneo y reduce la regurgitación mitral. La miectomía se utiliza si los medicamentos no alivian los síntomas. La mayoría de las personas que tienen síntomas y se someten a miectomía no tienen más síntomas. Este tipo de cirugía sólo está disponible en centros médicos especializados en el tratamiento de la cardiomiopatía hipertrófica
• Ablación septal: También se llama ablación septal percutánea. Es un tratamiento en el que se destruye una pequeña porción del músculo cardíaco engrosado mediante la inyección de alcohol a través de un catéter en la arteria que suministra sangre a la misma. Hay posibles complicaciones con este procedimiento, como un bloqueo cardíaco (una interrupción del sistema eléctrico del corazón) que exige la implantación de un marcapasos
• Implantación de marcapasos: Un marcapasos es un pequeño dispositivo electrónico insertado bajo la piel que envía señales eléctricas al corazón para vigilar y regular los latidos del corazón. La cirugía para el implante de marcapasos se realiza generalmente bajo anestesia local y suele durar menos de tres horas. La implantación de marcapasos generalmente no es tan eficaz como las opciones quirúrgicas, pero a veces se utiliza en  personas mayores que quieren evitar procedimientos más invasivos
• Desfibrilador cardioversor implantable: Se trata de un dispositivo del tamaño de un “busca” implantado en el pecho como un marcapasos. El dispositivo monitorea continuamente el ritmo cardíaco. Si se produce una arritmia potencialmente mortal, el desfibrilador administra cuidadosamente descargas eléctricas calibradas para restablecer el ritmo normal del corazón. Algunas personas con cardiomiopatía hipertrófica están en riesgo de muerte súbita cardiaca debido a ritmos cardiacos anómalos. En estos individuos de alto riesgo, muchos médicos recomiendan la implantación de un desfibrilador cardioversor implantable

Las personas con miocardiopatía hipertrófica que pueden ser candidatos para el implante de desfibrilador cardioversor son aquellas con:

• Un paro cardíaco previo
• Uno o varios miembros de la familia con muerte súbita causada por cardiomiopatía hipertrófica
• Desmayos inexplicables
• Episodios de taquicardia
• Presión arterial que no se eleva durante la prueba de esfuerzo
• Ecocardiograma que detecta espesor extremo de la pared del ventrículo izquierdo