Las causas de la queratitis son:

• Lesiones: Si un objeto rasca la superficie o penetra en la córnea, se puede producir una queratitis sin infección. Además, una lesión puede permitir la entrada de bacterias o de hongos y acceder a la córnea a través de la superficie dañada, causando una queratitis con infección
• Lentes de contacto contaminadas: Las bacterias, hongos o parásitos, en particular la Acanthamoeba, un parásito microscópico, pueden habitar la superficie de una lente de contacto y contaminar la córnea cuando la lente está en el ojo, dando lugar a una queratitis infecciosa
• Virus: Los virus como, el virus del herpes y el virus que causa la clamidia, pueden causar queratitis
• Agua contaminada: Las bacterias y los hongos del agua, particularmente en océanos, ríos, lagos y bañeras de agua caliente, pueden entrar en los ojos al nadar o bañarse y resultar en queratitis. Incluso si una persona se expone a estas bacterias y hongos, es poco probable que una córnea sana se infecte, a menos que haya habido algún fallo físico del delicado tejido de la superficie de la córnea (epitelio de la córnea). Por ejemplo, la desintegración física del epitelio corneal puede deberse al uso de una lente de contacto demasiado tiempo, lo que hace vulnerables a la córnea a una queratitis infecciosa